come si sistema senza reintallare il tutto? che tipo di problemi può dare se lo lascio così?
L'allineamento fa coincidere il settore fisico del dispositivo (e purtroppo ancora gli ssd sono plasmati sulla struttura degli hdd) a quello logico.
Se non c'è questa sincronizzazione (disallineamento), vengono eseguiti diversi cicli di lettura-modifica-scrittura che possono compromettere le prestazioni dell'unità disco... in sostanza gli si sfalsa come memorizza i dati il sistema operativo, rispetto alla struttura sottostante del device (hdd o ssd) e il dato (semplifico) alla fine della scrittura che dice al sistema operativo "l'informazione xyz è memorizzata al punto 1" non è preciso come dovrebbe e il sistema operativo non trova tutto al punto 1 ma deve cercare i frammenti "scivolati" più avanti e ricostruirli (perdendo tempo, energie).
Un hdd lavorerebbe di più abbreviando la propria vita, un ssd che non ha parti meccaniche, consuma di più, toglie risorse al controller, impiega più tempo nel seek time (la ricerca del dato), ma non accorcia la propria vita.
Ora veniamo al dunque...
nonostante la prima partizione sia perfetta, la partizione dove risiede il sistema operativo non è allineata sul serio.