Si è creato un casotto, probabilmente dovuto ad una nuova installazione o aggiornamento durante la quale sono state duplicate le partizioni.
Che il disco sia in uso al 100% però è un'altra cosa, non dipende certo da questo, forse c'è qualche malware...
Come detto da gronag ti conviene piallare tutto e reinstallare da capo il sistema: durante il processo di installazione elimina tutte le partizioni che non ti servono in modo da lasciare lo spazio come "non allocato". A quel punto seleziona questo spazio come destinazione a vai direttamente avanti: sarà Windows a creare le partizione che gli servono e procedere.