Se un hdd ha dei settori danneggiati, il firmware di questo cerca di riallocarli (infatti sul tuo seagate ci sono diversi settori già riallocati).
Il processo di riallocazione dei settori avviene in background, ma ciò comporta rallentamenti del sistema o blocchi, se i settori sono troppo danneggiati allora non possono essere riallocati e vengono quindi contrassegnati come pendenti ( come nel caso del tuo samsung esterno). I settori pendenti causano ancor più instabilità di sistema.
Forse non hai notato problemi quando collegavi l'hdd esterno alla usb perchè lo attaccavi solo dopo che windows era già avviato, prova a tenerlo collegato mentre avvii il sistema e vedi se ti da problemi.
Potrei provare a staccarlo ed attaccare solo il samsung per verificare allora
Come vorresti verificarlo se non colleghi il disco di boot a windows?
Dovresti usare un programma DOS, tipo MHDD da avviare da CD o da chiavetta.
Sopra 1 TB non consiglio alcun WD, a parte i Red e i RE e i Purple.
Tieni presente che sopra 1 TB non esistono Blue, sopra quel taglio i Blue sono in realtà tutti dei Green (anche se hanno l'etichetta blue).
Se vuoi proprio un hdd sopra i 2 TB, ti consiglio Toshiba, Hitachi, HGST.