AHCI è la modalità sata nativa; le sue prerogative sono l'indipendenza dei dispositivi l'uno dall'altro (nessun "master" o "slave" come nei vecchi controller IDE) e la miglior organizzazione dei comandi. È particolarmente raccomandato con i dischi SSD, ma anche con gli hard disk può avere benefici. La modalità IDE emula invece la struttura e i comandi dei vecchi controller IDE; è indicata solamente con sistemi operativi di passata generazione, come XP, con i sistemi attuali meglio utilizzare la modalità AHCI.