Per installare Windows in una partizione GPT occorre per prima cosa installare la versione a 64 bit; poi occorre avviare il dvd di installazione in modalità UEFI. Entra nel bios, vai in "Boot", entra in "CSM parameters" e controlla i valori di boot: è indispensabile che in "Boot Device Control" e in "Boot from Storage Devices" sia impostato "UEFI and Legacy", oppure direttamente "UEFI only", ritengo che attualmente sia impostata la modalità "Legacy", fattore che impedisce l'installazione di Windows nell'hard disk GPT.
P.S. Prima di compiere operazioni delicate, sarebbe meglio fare un backup del sistema, e, nel caso si tratti di un portatile, creare il set di dischi di ripristino.