sia su z690 che su z790 le linee pcie 5.0 sono riservate alla GPU 1×16, la differenza è maggior larghezza di banda per i dati, più linee pcie 4.0 (20) contro le (12) di z690, con una riduzione di quelle 3.0 (8) contro (16) di z690, questo vuol dire che potresti utilizzare fino a 4 m2 pcie 4.0 senza saturare la banda, il supporto a m2 pcie 5.0 non c'è, ne su z690 ne su z790, ce l'ha solo amd su alcune b650e/x670e, e tra l'altro se ne trovano pochissimi in commercio e costano uno sproposito, 4.0 sono più che sufficienti e accessibili.
oltre a questo possono essere presenti più porte usb da 20 Gbit/s o type-c, per il resto non ci sono differenze vanno bene entrambi, nell'eventualità dovessero uscire i refresh di raptor, sarà possibile montarli anche su z690 previo aggiornamento bios.
per le ram per me delle buone 6000mhz c30/32 rimangono la soluzione migliore costo/prestazioni, se proprio vuoi azzardare 6400mhz, anche se il guadagno sarà minimo, andare oltre attualmente a poco senso il costo non lo giustifica.
andrei di z790 i prezzi dovrebbero essere più accessibili, asus o msi, piattaforma più recente, i valori a stock dovrebbero essere migliori, (anche se ti servirà comunque l'undervolt) e ti eviti il flash del bios.