La CPU non arriverà mai a 100°C! Salvo casi rarissimi, ci sono sistemi di protezione contro le temperature, solitamente si rallenta, in altri casi il pc è riavviato o spento.
Se, come ci hai fatto capire, la CPU non lavora al 100% quando il computer è in uno stato normale (per intenderci: quando hai avviato Windows e tutti i processi sono stati caricati e quindi hai la schermata del desktop davanti) allora il problema non sussiste. Non ci sono problemi di sorta, la CPU funziona correttamente ma le prestazioni dei programmi che usi vanno oltre quelle che può supportare il tuo processore.
Se invece il pc continua a lavorare al 100% in modalità "normale" allora fai CTRL+ALT+CANC, apri il Task Manager (Gestore attività), vai su Prestazioni, Monitoraggio risorse e su Panoramica.
A questo punto allinea i processi secondo il consumo di CPU, quello/i che consuma più del 75% è il processo coinvolto. Talvolta sono più processi uguali o simili che consumano poco ma che nel complesso sfruttano tutta la CPU.
Dacci il nome di tale/i processo, si vede subito se è un malware o meno.
NB: Molte volte il computer, specialmente dopo gli aggiornamenti, mantiene i consumi della CPU altissimi anche dopo un'ora dall'avvio del sistema, ciò è dovuto alla compilazione di librerie; mi è successo nel caso di un aggiornamento di .NET Framework.
Spero non tu debba seguire la procedura, nel caso in cui invece tu fossi costretta, facci sapere.