Premesso che si puoi installare i programmi/giochi dove vuoi anche su pendrive, il problema sta nella velocità di lettura/scrittura dei supporti, un HDD interno essendo collegato via SATA in genere è più veloce di un HDD esterno collegato via USB. Personalmente ti consiglio di utilizzare il metodo "standard" ovvero l'abbinamento SSD HDD interno dove mettere sistema operativo e programmi frequenti e importanti sul SSD e tutto il resto su HDD compreso i giochi