Se hai ancora dati da recuperare non dovresti aggiornare nulla, meno lo usi quel hdd e meglio sarà.
E' possibile che a causa dei settori danneggiati la copia di windows si sia interrotta, per cui è verosimile che ti manchino dei files.
Il mio consiglio è di rivolgerti ad un professionista in recupero dati se ritieni i tuoi dati importanti, altrimenti rischia ma in modo più intelligente, cioè cerca di clonare l'hdd a basso livello con programmi quali DDRescue in Linux o DMDE per DOS, non sono facili da usare ma almeno è possibile fare qualcosa per gestire in automatico i settori danneggiati in modo che la copia non si interrompa.
Windows è pessimo per copiare i dati da hdd che hanno settori danneggiati!
Per clonare ti servirà come destinazione un hdd nuovo di capacità pari o superiore, non utilizzare assolutamente un hdd che ha dentro dati che ti servono, ciao.