Esatto, e come vedi usare DLG Diag è servito (purtroppo non per risolvere il problema): ora puoi fare RMA presso WD indicando il codice di errore, così sei sicuro che accetteranno la tua RMA e che ti sostituiranno il drive.
Un problema software può corrompere il file system, fino addirittura a compromettere il funzionamento del sistema operativo, se il disco fosse quello di sistema; però questi errori sono errori "logici", nulla che una bella formattazione o un un checkdisk approfondito non possa risolvere. L'utility di WD opera a basso livello, e se riscontra errori irreversibili significa che il danno è a livello fisico; un errore sofware non può danneggiare fisicamente il disco: le testine possono cercare di leggere un settore anche milioni di volte ma non toccano mai quel settore fisicamente, e non vanno mai in "confusione" ;). Anzi, più verosimilmente è il contrario: forse c'erano problemi ad accedere a quella cartella proprio perché in parte residente su settori difettosi, quindi la causa del problema è un'altra, molto probabilmente il drive è difettoso all'origine.