Non c'è nessun legame tra il registro di sistema ed un SSD!
Il registro di sistema contiene tutta una serie di impostazioni, configurazioni, legami, link che riguardano l'intero Windows e tutti i programmi che vengono installati su di esso (app, giochi etc.)... per farla semplicissima è un enorme raggruppamento di testi...
Ripulirlo in breve significa eliminare collegamenti morti, impostazioni di programmi mancanti e roba simile....
Non c'e nessun legame con un SSD o HD che invece contiene fisicamente (se si può dire cosi) tutto il sistema (files e directories) compreso il registro di sistema
Più che altro bisogna prestare attenzione a variare alcune impostazioni che potrebbero "infastidire" il lavoro dell'SSD...
Comunque mettere mano dentro il registro, se non si sa cosa si tocca è sempre pericoloso!