Un disco partizionato ha dei vantaggi e degli svantaggi... lo svantaggio è avere una partizione C più piccola e dover spostare via via i dati utente nella partizione D... Il vantaggio è che è molto più facile reinstallare Windows già che la maggior parte dei dati li hai nella seconda partizione....
La cosa migliore sarebbe cambiare il percorso di default delle cartelle Documenti, musica, immagini, video nella seconda partizione... Altrimenti devi usare un programma come Easeus partition master... ma devi fare un backup di tutti i dati riunire due partizioni è una procedura che contiene una certa percentuale di rischio e non è consigliabile farla senza prima fare un backup!