So che hai già detto di aver provato programmi differenti, ma io l'ho fatto per la prima volta qualche giorno fa con la trial di 30 giorni (perché la Free che appare essere uguale ti permette di clonare soltanto partizioni appartenenti allo stesso Disco Drive fisico) di EaseUS Todo Backup Home e non ho avuto alcun problema.
Ho migrato completamente tutto da un HDD (D) ad un SSD (E) facendo però partire il programma da un terzo HDD (C) temporaneo.
Durante la preparazione ho spuntato una casella denominata "ottimizza per SSD", dopodiché la procedura è andata a buon fine dopo circa un'ora.
Nel mio caso, sebbene lo spazio occupato sull'HDD non fosse molto, durante la preparazione avevo la possibilità di flaggare un'ulteriore opzione, che permetteva di copiare in modo identico tutti i settori, compresi quelli "bianchi/vuoti", quindi rappresentate spazio non occupato, ma non ho potuto farlo perché l'SSD avrebbe dovuto avere la stessa capienza complessiva, o maggiore, dell'HDD di origine.
Non so a cosa questa opzione servi esattamente, quali sono i pro, e le utilità che porterebbe quest'ultima, ma nonostante non l'abbia fatto, poiché impossibilitato, al termine della procedura una volta rimossi i 2 HDD e lasciato solo L'SSD, mi sono ritrovato esattamente tutto ciò che avevo prima allo stesso modo, senza brutte sorprese, o errori, ed all'inizio ero totalmente scettico
Il sistema operativo in questione era Windows 7, ma magari non centra nulla, forse devi semplicemente effettuare il tutto da un terzo supporto, come ho fatto io (non per gli attributi particolari irremovibili dei file e delle cartelle di sistema, ma più per il fatto di mantenere libero da scrittura il supporto di origine)
Magari puoi provare un altro software, dallo screen da te postato per esempio non vedo molta differenza tra le 3 opzioni, Clona Disco, Clona Sistema e Clona Partizione, ma credo che qualora non cambiassi anche componenti hardware, la scelta giusta sia Clona Disco