Sulla tua scheda madre ci sono 3 slot PCI Express 16x adatti alle schede video, ma solo uno, quello verde, è il primario con la connessione 16x elettrica, quello blu (dove credo tu abbia installato la scheda video) è solo 8x mentre quello arancione in fondo è 4x.
Come prestazioni cambia poco, in realtà, ma se non hai esigenze particolari di spazio (vale a dire, se la scheda video non interferisce con qualche componente) la potresti spostare sullo slot verde in maniera da sfruttare al massimo la connessione. La frequenza della scheda video è sempre la stessa, cambia la banda dati di connessione con la scheda madre, che ovviamente a 16x è alla massima velocità possibile.