devi configurare il bios, nella schermata boot scegli la priorità delle periferiche, ovvero dici al pc dove deve andare a caricare il sistema operativo. puoi scegliere tra: cd rom, hardisk1, harddisk2 ssd, usb, e altre.
per esempio per fare l'installazione da zero devi dire al pc di caricare il sistema operativo dalla periferica usb, in quel modo ti partirà l'installazione. ormai le macchine moderne hanno PURE un tasto di avvio rapido per non dover cambiare la sequenza di boot ogni volta.
ma cambia da pc a pc, in genere è f2 , f8, f12 ,e con canc accedi invece al bios, lo devi premere subito e ripetutamente appena accendi il pc per accedere alla schermata, se sei lento il sistema inizia la fase di boot e carica il sistema operativo installato.
la DEFRAMMENTAZIONE la puoi fare quando vuoi, dipende se sceglierai di mantenere 2 sistemi operativi installati (posso tranquillamente coesistere) o solo uno, se scegli di mantenere solo un SO, tutto quello che sta sul vecchio disco è inutile deframmentarlo, sposti i dati personali momentaneamente sull ssd, formatti il vecchio disco, e gli rimetti i dati.
se invece vuoi tenere 2 sistemi operativi (non si sa mai il primo avesse problemi) dopo aver disinstallato i programmi che non userai, e ridotto al minimo l'occupazione di windows tramite la pulizia, gli avvi la deframmentazione.
ti mando il link ad una guida.