Quando senti il rumore prova a rallentare le ventole in qualche modo, quella della Cpu puoi usare un dito toccando la parte centrale (dove non ci sono le pale) se il rumore smette allora sono le ventole.
Apri il case e da uno sguardo mentre fa rumore, la facscetta potrebbe già essere dentro non necessariamente l'hai messa tu o anche uno dei cavi che urta contro una ventola.