Magari si può usare un altro slot pci-e ma non sarebbe 16X.
Potrebbe essere un problema di montaggio, come se la scheda sia rimasta sollevata dal lato del bracket vuoi perchè non inserita a fondo o il case scarso e con tolleranze errate o magari sono stati usati i distanziali sbagliati e la mobo è più bassa di quello che dovrebbe essere. Nel secondo caso anche le porte posteriori e la mascherina IO posteriore dovrebbero essere disallineate col case. Oppure non è stato messo il distaziale sotto alla mobo in quel punto per cui si è piegata sotto la scheda non facendola inserire bene nello slot.