innanzitutto credo che sia il caso di installare una distro "per bene" (slackware o debian, o simili, non cose troppo grafiche) e fare un po' la mano su come configurare le varie cose, soprattutto chiudere servizi non necessari e simili). secondo me il sistema di init della slack e' piu' semplice da editare a mano, per cui la consiglio, ma sono gusti (ovviamente sbagliati quelli di chi la pensa altrimenti :D :figo: )
poi gli appunti di informatica libera vanno benissimo, pero' bisogna aggiungerci le guide per l'amministrazione e simile che si trovano su
The Linux Documentation Project e forse su
Italian Linux Documentation Project, soprattutto per quello che riguarda la sicurezza.
a quel punto dipende da che server si vuole: un serverino web senza troppe pretese e' bene o male alla portata di tutti, per il resto si possono leggere i manuali e vedere cosa dicono a seconda dei casi.