Clonezilla va scaricato in versione iso, masterizzato o tramite pennetta e avviato come hai fatto con linux. Bypassa Windows quindi, ma non è detto che riesca nell'operazione.
Hai provato con test disk e photorec a recuperare i file?
Si ho tentato ma ciò che manca non l'ho recuperato ancora..riprovo di nuovo domani e ti faccio sapere. Per intanto scarico clonezilla e ti ringrazio :)