Tipo seagate offre
Seatool che ti permette di fare un diagnostica dell'hd e di fare la formattazione a basso livello.
Credo che il tuo hd abbia qualche settore danneggiato e con il ripristino sei andato a mettere i file di avvio (boot) in quei settori.
A me è succeso la stessa cosa con il mio hd, e leggendo quei settori il mio hd non veniva piu riconosciuto a meno che non toglievo allimentazione dall'hd. Nel mio caso cerano talmente tanti settori danneggiati, da non poterli piu sostituire e quindi ho dovuto ridurre il mio hd da 320gb a 60gb.
I settori danneggiati sono solo un'avvertimento per la rottura definitiva dell'hd.
La formattazione a basso livello risolve il problema nella maggior parte dei casi
Potresti usare anche HDD Regenerator, quando lo usavo io ti permetteva di fare la scansione e di riparare un settore, per tutti gli altri dovevi acquistare la versione pro