Bene, questo ti dà la garanzia di riuscire ad installare un nuovo sistema operativo, come ti hanno detto in fase di installazione devi spuntare la casella dove dice di mantenere i file. Fai attenzione, se ti sbagli sovrascrivi tutto e perdi i dati.
Io starei sul sicuro, dato che dici che per te non è un problema smontare un disco, ma il disco che smonti lo devi collegare ad un altro pc tramite interfaccia USB, in questo modo lo vedi come una chiavetta, copi i dati sul pc ospite e a quel punto rimonti il disco sul laptop e installi da zero cancellando le partizioni dal gestore di Windows dopo il boot da chiavetta.