Esistono due modi per attivare o disattivare il software PunkBuster: scrivendo dei comandi nella console del gioco, oppure utilizzando l'interfaccia del gioco. Entrambi verranno descritti più avanti. Comunque, quando è disattivato, PunkBuster ignora i cambiamenti delle impostazioni e tutti i comandi, tranne quello che lo attiva. Cliccando su 'Multiplayer' (multigiocatore) nella schermata principale del gioco, si raggiunge l'elenco dei server e la schermata di selezione. Nella porzione centrale di quest'ultima si trova un pulsante su cui è scritto 'PunkBuster Enabled' (PunkBuster attivato) o 'PunkBuster Disabled' (PunkBuster disattivato). Cliccaci sopra per cambiare lo stato attuale di PunkBuster. Apparirà una piccola finestra di dialogo che ti chieder conferma. Quando avrai confermato, il pulsante indicherà il nuovo stato di PunkBuster.