Eh...quesito shakespeariano. Dipende tanto da che utilizzo ne vorrai fare.
Indubbiamente l'Ipad 3 ha uno schermo (Retina) migliore, e la differenza si nota tanto. Io ce l'ho e l'ho confrontato con un Asus Transformer con risoluzione 1280x800, come il Note 10.1, e la differenza si vede: le immagini sono più nitide e la lettura dei testi è migliore a mio parere. (io ho scelto l'Ipad 3 per quello, sostanzialmente)
L'Ipad ha una scocca in alluminio, credo migliore di quella del Samsung in plastica...poi dipende dai gusti. certo è che il Samsung "scricchiola" un po'.
D'altro canto il Samsung è decisamente più versatile, come un po' tutti i prodotti non Apple:
-Flashplayer
-Bluetooth 4.0 che riconosce qualsiasi dispositivo e non solo quelli Apple.
-Flash nella fotocamera posteriore
-Slot microSD
-Sistema operativo personalizzabile
-Multischermo: fino a 4 applicazioni aperte contemporaneamente visibile nello schermo.
...
Per quanto riguarda le prestazioni, il Samsung nei test ha qualche punto in più, ma niente di importante.