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Non che l'idea che hai di formattare i dischi nel momento dell'installazione sia sbagliata, ma installare con solo un drive connesso (l'ssd) evita la fastidiosa condizione di vedersi attivata la partizione di sistema nel hdd invece che nel ssd, dovendo poi, una volta scoperto che:
"ho il sistema operativo su ssd ma non mi fa formattare l'hdd..." oppure "ho il sistema operativo su ssd ma è lento..."
l'unica via sia rienstallare di nuovo. ;)
Quando hai tutto su ssd usa le funzioni di "gestione disco" sull'hdd per eliminare le partizioni e formattare.