Ciao!
Se l'hai formattato con dei filesystem di linux (tipo Ext2,3 o ReiserFS) Windows non li può leggere.
Verifica in pannello di controllo -> strumenti di amministrazione -> gestione pc -> gestione disco logico se il disco viene visto (dovrebbe avere diverse partizioni con filesystem di tipo Sconosciuto ma integro).
Purtroppo non puoi leggerlo da win in tal caso (o meglio, ci sono dei driver non ufficiali che permettono di leggerli ma te li sconsiglio) la cosa migliore è avviare una distro linux live e copiare i files su una partizione FAT o NTFS (se la distro riesce a scriverci sopra)...