In linea di principio uno dovrebbe acquistare una scheda madre in base alle proprie esigenze e al proprio budget.
Esempio (riferito ai modelli oggetto della discussione): occorre fare Crossfire/SLI? Meglio la UD4. Si intende installare una sola scheda grafica? Può bastare la UD3. Servono due connettori eSATA (a me, per esempio, servono perché ho due HDD esterni eSATA :))? Sì! Allora meglio la UD4, che ha un controller dedicato con 2 porte eSATA. No? Allora può bastare la UD3.
Sia la UD3 che la UD4 sono ottime schede, e dunque personalmente applicherei un criterio di questo genere per la scelta, considerato inoltre che tra i due modelli ci sono 40 € di differenza, e non è poco. Visti i criteri espressi da Karbunen due post sopra, direi proprio che la UD3 possa andare bene. ;)