Ti dico le maggiori differenze senza scendere nei particolari. Sono le possibili modalità in cui si possono settare i controller SATA delle schede madri.
IDE (su alcune schede madri indicato come Compatible)= modalità compatibile con windows XP (sarebbe meglio dire che Windows XP non necessita di driver del controller per installarsi su un disco rigido collegato). Sconsigliato nell'uso degli SSD (prestazioni inferiori, soprattuto nel caso di diverse operazioni in contemporanea)
AHCI (su alcune schede madri indicato come ENHANCED)= windows XP necessita driver per rilevare unità collegate al controller sata (in genere Windows 7 e 8 non ne hanno bisogno). Modalità consigliata se si utilizzano SSD (danno il massimo delle prestazioni)
RAID = permette la creazioni di vari tipi di RAID (0 - 1 - 0+1 - 1+0 - 5 - ecc a seconda del controller SATA); ossia permette di utilizzare più dischi (in genere DEVONO essere uguali, o comunque molto simili per dimensioni e prestazioni) per ottenere scopi diversi (principalmente o maggiori performance o tolleranza alla rottura dei dischi, a volte entrambe). Nel caso di SSD collegati ad un controller RAID ma non facente parte di raid (es 2 hd magnetici in RAID 1 per migliorare la tolleranza alla rottura + un SSD per il boot di sistema), l'SSD si comporta come se fosse collegato ad un controller configurato come AHCI (ottime performace). Nel caso di 2 SSD collegati in RAID tra loro possono sorgere delle problematiche a seconda del controller sata utilizzato a causa dell'impossibilità del Sistema operativo di inviare il comando TRIM (serve a mantenere alte le prestazioni degli SSD) quindi, col passare del tempo, si ha una degradazione della performace. Attualmente solo i controller INTEL NATIVI montati su schede madri con chipset della serie 7 supportano il TRIM con SSD in RAID.
Come si capisce da quanto sopra, la modalità utilizzata è importante per gli SSD, con i dischi magnetici le differenze di prestazioni sono talmente basse da poter lasciare il sistema indipendentemente in IDE/AHCH/RAID ...