Immagino che ciascun programma stabilisca da sé dove posizionare il codice della licenza, così come è possibile che venga salvato in maniera criptata.
Né è detto che venga salvato necessariamente nel registro, potrebbe essere in scritto una qualche cartella in AppData.
Insomma credo proprio che, a meno che non precisi di quale specifico programma stai parlando, sia praticamente impossibile dare una risposta univoca.